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PDBML

网络Protein Data Bank Markup Language

PDBML

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PDBML

Protein Data Bank Markup Language

...换的简便性，PDB 数据采用的是 XML 格式。这种 XML 格式由名为 Protein Data Bank Markup Language (PDBML) 的 XML S…

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The large number of optional PDBML elements allow the documents to be very flexible and highly variable.

大量的可选 PDBML 元素让文档非常灵活和高度可靠。

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4

Additionally , an XQuery Update expression can delete the subtree from the each PDBML document inserted into the pdbxml table .

此外，XQueryUpdate 表达式可以从每个插入到 pdbxml 表的 PDBML 文档中删除子树。

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The second table (xmlrpdb. atom_site) contains one relational row for each atom coordinate (i. e. , for each element in a PDBML document ).

第二个表（xmlrpdb.atom_site ）包含了每个原子坐标的一个关系行（即，PDBML 文档中的每个元素）。

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The column pdb_id is the foreign key that links atom coordinates to the corresponding PDBML document in the pdbxml table .

列 pdb_id 是一个外键，链接了原子坐标与 pdbxml 表中对应的 PDBML 文档。

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Listing 1 shows an extract from one PDBML document .

清单 1 显示了一个 PDBML 文档摘录。

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